土壤-植物系统对废水的净化作用是一个十分复杂的综合过程，其中包括物理过程的过滤、吸附，化学反应与化学沉淀以及微生物的代谢作用下的有机物得分解和植物吸附等。当废水流经土壤时，土壤颗粒间的空隙具有截留、滤除水中悬浮颗粒的性能；土壤中黏土矿物颗粒能吸附中性分子污染物，废水中的金属离子与土壤中的无机物和有机胶体颗粒由于螯合作用形成螯合化合物，或生成复合物。

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